核苷(酸)类药物的治疗过程中，从病毒变异到临床耐药是一个逐渐发生的过程。开始，体内可能有少量变异的病毒株。尽管这些病毒对药物抵抗力强，但其复制能力比野生病毒株差。因此，体内的野生病毒株仍占“优势”，变异病毒成不了“气候”。随着拉米夫定应用的时间延长，对拉米夫定敏感的野生病毒株被药物的“火力”攻打得抬不起头来了，而耐药的变异病毒株凭借自己的抵抗力“躲过”了药物攻击，被“筛选”出来，得到拼命复制的机会，逐渐增多，成为体内的“优势”株。这时才会出现病毒学和肝功能反弹，导致临床耐药发生。

　　为了准确地反映这种从病毒变异到临床耐药的过程，医生们把病毒变异后的耐药分为基因耐药、病毒学耐药和临床耐药三个阶段。“基因耐药”是指在抗病毒治疗过程中体内乙肝病毒基因组产生了变异，形成新的耐药性病毒基因序列，但这种耐药病毒株在体内的量很少，还没有形成“气候”，只能通过病毒基因的检测查到变异病毒株；“病毒学耐药”是指在基因耐药的基础上继续发展，变异病毒株逐渐增多，由于它们的复制，使血中HBV DNA水平反弹，一般在(1×10³)～(1×10⁶)拷贝/毫升之间，还没有造成肝功能异常和明显的肝脏组织学损伤；病毒学耐药继续发展，HBV DNA水平上升至1×10⁶拷贝/毫升以上，最终出现肝功能异常、肝脏组织学损伤，即发展到“临床耐药”阶段。因此说：从病毒变异到临床耐药是一个逐渐发生的过程。病人在治疗过程中至少每3个月到医院检测一次，及时发现耐药，及时更改治疗方案，才能达到持续抑制乙肝病毒的目的。