对于慢性乙型肝炎，经过规范的普通干扰素治疗效果不好的患者，再次应用普通干扰素治疗的疗效很低，可试用长效干扰素治疗。长效干扰素的半寿期长，可以在血液中形成一个血药的稳态浓度，保持对病毒的持久抑制作用，因此，长效干扰素治疗慢性乙型肝炎使普通干扰素对乙型肝炎的疗效从25%上升了10个百分点，提高了干扰素治疗慢性乙型肝炎的疗效。尽管如此，长效干扰素的实质还是干扰素，其疗效仅提高10%左右。因此，普通干扰素无效的患者可以试用长效干扰素，但失败率也是较高的，最好换用核苷(酸)类似物治疗。普通干扰素治疗失败的患者，如果有以下两种情况者可以考虑试用长效干扰素α-2a：①换用其他类型干扰素，如以往治疗的普通干扰素属于干扰素α-2b或干扰素α-1b，可换用长效干扰素；②因普通干扰素频繁注射不能坚持者。

对于慢性丙型肝炎的患者在使用普通干扰素治疗效果不好时，可改用长效干扰素加利巴韦林联合治疗。